研究人员对人参进行基因组测序
中国科学家团队组装了中国传统中药代表植物人参(Panax ginseng)的端粒到端粒参考基因组。
人参是最重要的药用植物之一,生长于中国、韩国、西伯利亚和日本等东北亚地区,北美也有少量种植。
根据中国古书《神农本草经》的记载,人参是多年生植物的根,几千年来一直被用作传统药物,同时也是一种功能性食品和饮料,具有增强体质和免疫力的功效。
人参的野生采集历史非常悠久,约500年前就开始栽培,并开始进行育种,并普遍形成了栽培品种。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所的李伟博士及其同事说:“与其他草药一样,药用人参具有复杂的代谢物,被认为是有效化合物,其中三萜皂苷(人参皂苷)是最重要的类型。”
“人参中可能含有上百种人参皂苷,但绝大多数人参皂苷的合成途径仍未阐明。”
在他们的新研究中,李博士和合著者组装了端粒到端粒的人参参考基因组。
他们解释说:“利用这个端粒到端粒的参考基因组,我们研究了人参的系统发育和进化,并检查了其亚基因组之间基因的不对称丢失和偏向表达。”
作者在 3.45 Gb 的人参基因组中鉴定了 77,266 个蛋白质编码基因。
他们还发现其亚基因组中存在不对称基因丢失和基因表达偏差,并将其分化时间追溯到大约 607 万年前。
他们的分析强调了与皂苷生物合成相关的广泛基因家族扩展,并强调了特定基因重复在增强这些途径中的重要性。
与相关物种的比较基因组分析提供了进一步了解人参为优化其药用价值而采用的进化策略的见解。
李博士说:“人参基因组的完整组装是植物学研究的一项巨大成就。”
“它不仅拓宽了我们对药用植物遗传复杂性的理解,而且还介绍了培育具有优良健康特性的人参品种的精妙方法。”
“人参基因组的全面解码为提高其药用功效的精准育种技术奠定了基础。”
“这项研究不仅对加强人参种植具有直接应用价值,而且可以作为研究其他药用植物的模型,有可能彻底改变药理学和利用天然产物进行作物增强的策略。”
研究结果发表在《园艺研究》杂志上。
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