从基因组到花园引入园艺作物搜索引擎

随着基因组学彻底改变了我们对园艺作物的认识，研究人员经常要处理分散而复杂的基因组数据。这种碎片化严重阻碍了有效的分析和应用，因此迫切需要更具凝聚力的研究工具。

满足这一需求对于充分发挥基因组学的潜力以在日益增长的农业需求下提高作物的质量、多样性和恢复力至关重要。

北京农学院的研究人员与国际科学家合作，宣布开发了HortGenome搜索引擎(HSE)，并于2024年4月8日发表在《园艺研究》上。

该研究引入了一种新颖的搜索引擎，旨在查询和分析500 多种园艺作物的基因组数据，增进我们对基因功能和作物改良的了解。

HSE 将来自 500 多种园艺作物的基因组数据整合到一个统一的平台中，提供轻松访问和高效比较遗传信息的功能。HSE 配备了基本局部比对搜索工具 (BLAST) 和同源性查看器等先进工具，简化了基因查询和功能注释流程。

批量查询界面和富集分析等功能简化了数据导航，提高了研究效率。该引擎能够识别关键基因家族，如番茄中的 TCP 转录因子，凸显了其在推动基因组研究和农业创新方面发挥的重要作用。

HSE 的联合开发者张军飞博士表示：“HortGenome 搜索引擎是园艺基因组学的重大突破，提供了无与伦比的大量基因组数据访问途径。该工具彻底改变了植物基因组研究，大大加快了作物改良的发现和应用。”

HSE 不仅简化了基因组研究，还对作物育种和基因保护产生了深远影响。通过简化基因组数据访问和分析，HSE 使研究人员能够快速确定与所需性状相关的基因，从而加速培育营养更丰富、适应性更强、更符合可持续农业实践的作物品种。