菠萝薄荷基因组测序

研究人员成功破译了菠萝薄荷(Mentha suaveolens)的基因组，菠萝薄荷是一种因其独特香气和药用价值而备受推崇的草本植物。

菠萝薄荷 (Mentha suaveolens) 因其独特的香气和商业价值而在世界各地种植。图片来源：Yang et al.，doi：10.1093/hr/uhae022。

菠萝薄荷(Mentha suaveolens)因其独特的香气和商业价值而在世界各地种植。图片来源：Yang et al .，doi：10.1093/hr/uhae022。

薄荷属(Mentha )通常称为薄荷，包括唇形科(Labiatae)几种气味强烈的草本植物。

这种用途广泛的植物含有多种成分，如精油和非必需化合物，适用于广泛的潜在应用。

薄荷精油作为助消化剂和止痛剂具有悠久的药用历史。它具有多种生物活性(例如抗氧化、抗菌、抗辐射、抗癌和降血压)。

菠萝薄荷是苹果薄荷的栽培杂色形式。

它是一种世界各地生长的野生植物，由于其众多的治疗功效而被广泛应用于医学领域。

成都中医药大学的宋驰博士及其同事表示： “尽管这些特性非常重要，但由于薄荷基因组的复杂性，其特点是杂合性高、结构变异多，因此了解这些特性的遗传基础一直具有挑战性。”

“对薄荷基因组进行全面研究对于揭示影响其独特特征的遗传因素至关重要。”

在研究中，研究人员成功生成了菠萝薄荷第一个高质量的、单倍型解析的基因组组装，其基因组大小为414.3 Mb，包含31,251个编码基因。

通过整合来自各种测序平台的数据，他们解析了两个完整的单倍型组装，每个单倍型组装都几乎完全注释了端粒和着丝粒。

值得注意的是，他们揭示了 41,135 种结构变异，包括缺失、插入、重复和易位，其中许多影响参与萜类化合物生物合成的基因。

一个重要的发现是，菠萝薄荷产生的挥发性化合物中，氧化胡椒烯酮占主导地位，而薄荷醇则在其他薄荷物种中更常见。

作者确定了三种编码异胡椒烯酮还原酶(ISPR) 的基因，该酶是薄荷醇生物合成的关键酶，但发现它们低的转录水平可能会导致胡椒烯酮氧化物的积累。

宋博士说： “薄荷无间隙基因组的完成代表了植物基因组学的一个重要里程碑。”

“这张全面的基因图谱为探索菠萝薄荷独特特性的分子机制提供了基础，可能带来医学和农业领域的创新应用。”

该研究结果发表在《园艺研究》杂志上。